* Sultan Fatih'in oğludur.
* Adli mahlasını kullanmıştır.
* Yükselme Dönemi'nde Duraklama Dönemi yaşatan padişah olarak bilinir.
* Karamanoğulları beyliğine kesin olarak son verildi.
* Osmanlı Devleti ilk defa bu dönemde Memlükler ile mücadele içerisine girmiştir.
* Cem Sultan Olayı ile uğraşıldı.
* Şah Kulu İsyanı bu dönemde çıkmıştır.
* Ruhsal bozuklukların tedavisi amacıyla Edirne Bayazid Külliyesi içine bir şifahane inşa edildi.
* 1502 yılında Leonardo Da Vinci, II. Bayezid'a, Haliç üzerine yapılması için 240 metre uzunluğunda bir köprü projesi sundu ancak kabul edilmedi.
* Küçük Kıyamet (1509 İstanbul Depremi) meydana geldi.